細胞實驗室根據功能分區可以分為潔凈區和非潔凈區。

細胞實驗室潔凈區包含：更衣區;緩沖區;細胞制備區;細胞培養區;配液區;微生物檢測區。

細胞實驗室非潔凈區包含：樣本接收區;免疫檢測區;細胞生物學檢測區;理化檢測區;物料存放區;清洗消毒區;氣體儲存區;信息中心區;細胞儲存區;檔案存放區。

　　首潔凈室的凈高度應在2.5-2.8m之間。總體布局不應交叉混合使用，且應符合人、物分流的原則。人流通道、潔凈區入口應設緩沖室。廢物、污染物應設置專用傳遞窗，不應與細胞產品、潔凈物品合用一個傳遞窗。傳遞窗送風方式應采用上送側回的方式。通道門的開啟方向應由低潔凈級向高潔凈級的方向開啟。所有潔凈區不應安裝水池和地漏。

　　潔凈區的環境技術指標應符合以下要求：更衣、緩沖、細胞制備區、細胞培養區的空氣潔凈度應滿足C級。溫度應控制在22±4℃，濕度應控制在45%～65%為宜;

在通風方面潔凈區與非潔凈區之間、不同空氣潔凈度的潔凈區之間的壓差應>10Pa。潔凈區內不同功能及級別房間之間宜保持適當的壓差梯度，以防止污染和交叉污染;總送風量中(非單向流)應有10%～30%的新風量。